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我的异端之路 - 布朗斯通研究所

我的异端之路

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我会叹口气说这件事
因此,某个年龄段和年龄段:
两条路在树林中分叉,我—
我带走了一个较少的人,
这一切都有所不同。

罗伯特弗罗斯特

我生来就是一个正统的科学家,被扔进了传统学术的传送带。我妈妈 著名分子生物学家和导师 他从小就培养我的科学好奇心,在我们围坐在餐桌旁时给我讲解细胞,在我只有 5 岁时给我讲光合作用催化二氧化碳转化为糖和氧气的故事。

“二氧化碳是什么?”我会问。

“好问题!”妈妈会带着极强的热情感叹道。“整个宇宙,你能看到、感觉到和触摸到的一切,都是由原子组成的……”她抓住我的胳膊说,“如果你放大你的皮肤,你会发现它是由叫做细胞的活气泡组成的。如果你放大细胞,你会发现它们是由更小的叫做分子的东西组成的——脂肪、蛋白质、糖、核酸——如果你再放大分子,你会发现它们是由叫做原子的基本构件组成的。二氧化碳是一个分子,由一个碳原子和两个氧原子组成。我们呼吸的大部分空气都是由二氧化碳组成的……当我们吸气时,我们吸入氧气,当我们呼气时,我们呼出二氧化碳……”她会继续说下去,把我呼出的空气、植物吸入的空气和我吃的麦片中的糖联系起来。

可以说,我生来就拥有一位才华横溢的母亲赋予的天然科学天赋,在学校里也表现出色。我热爱我所学的一切,主修了两个学位——生物学和应用数学——还差点辅修了化学和心理学。本科期间,我从事研究工作,并被著名的美国国家科学基金会研究生研究奖学金项目录取。我申请了许多博士学位,最终被哈佛大学、斯坦福大学、普林斯顿大学等多所大学录取。在著名的导师西蒙·莱文博士的指导下,我仅用了短短四年半的时间就获得了普林斯顿大学的博士学位,之后又在杜克大学继续从事博士后研究。

我继续沿着学术正统的道路前进,从 2017 年开始在由 DARPA 资助的团队中工作,研究蝙蝠病毒的溢出。我帮助与我一起工作的团队成功撰写了一份 DARPA PREEMPT 拨款申请,旨在预测蝙蝠亨尼巴病毒的溢出并预防这些危险病毒的出现。 我发表了论文,在数学和生物学的前沿领域开发了新的创新方法。我沿着一条盛开的樱草花小径,直奔学院的大厅,大厅两旁挂满了历届学者的肖像,我满怀希望地期待着在大厅尽头看到自己的肖像。

一切已成过去。2019年我所展望的正统之路,如今已被迷雾笼罩,富丽堂皇的殿堂和画像已被烈火吞噬,学术之梦已然破灭。

发生了什么?我哪里出错了?

我在什么时候踏上了一条人迹罕至的道路?

我的异端罪孽

作为一名科学家,我忍不住要将观察到的现象分解成一系列具体的时间和因果关系单元,我希望能够理解这些事件背后的奥秘和原因。如果我能理解每一个事件,或许整件乱七八糟的事情就能更有意义了。

新冠疫情标志着我正统自我形象的终结​​。一系列事件开始揭示我的非传统性。在这些事件中,我不仅意识到自己非传统,还意识到学术界对非传统者并不友善。以下是我感兴趣的事件、我采取的非传统立场以及受到的待遇。

预测大流行

2020年XNUMX月下旬至XNUMX月初,我分析了武汉的病例增长率、病例报告发现的PCR检测高假阴性率、巴伐利亚州典型的非特异性症状传播病例研究等等,并开始相信大流行不可避免。我对病例增长率的估计要快得多,而且我的方法也不同于传统方法,因为我曾使用流行病学中不常用的方法来估计病例的增长率。更快的病例增长率导致对患病率的估计更高,增强了对更大亚临床病例冰山的信心,推迟了与武汉相连地区的疫情爆发日期,降低了旅行者筛查阻止大流行的可能性,并增加了大流行的可能性。

我曾尝试与 DARPA PREEMPT 团队的学者们分享我关于 2-3 天病毒倍增时间的发现,但一位牛津大学的教授却令人难忘地表示,他没时间听我说话。简而言之,他对哈佛大学、伦敦帝国理工学院和伦敦卫生与热带医学院的团队比对“蒙大拿州的博士后”更有信心。这些大型机构都估计病毒倍增时间为 6.2 天,亚临床率低,成功遏制的几率高,因此,仅凭他们的资历,他——我的队友——根本没时间听我的异见。我周围的其他人也同样反对,一位教授声称,如果我分享了我的结果,而我错了,可能会被福克斯新闻报道出来,引发自满情绪,我可能直接导致数百万人的死亡。

这一次,我选择隐瞒我的发现。这些警告世人闻所未闻,异端卡桑德拉声称自己不是流行病学家,并被迫坚守自己的立场。这些发现非但没有让人们预知即将到来的大流行病,反而被用来帮助一家对冲基金做空市场。

流感样疾病(ILI)论文

因为我相信流感的发病率会更高,增长率也会更快,所以我推测到 2020 年 XNUMX 月至 XNUMX 月,在纽约等美国主要大都市地区寻求治疗的患者数量会激增。基于这种数学上的预见,贾斯汀·西尔弗曼 (Justin Silverman)、纳撒尼尔·休伯特 (Nathaniel Hupert) 和我时刻关注着疫情,监测着美国疾病控制与预防中心 (CDC) 的流感样疾病数据集,该数据集报告了因流感样疾病 (ILI) 前往哨点初级保健提供者就诊的患者比例。

我们发现2020年8月患者数量激增。我们将流感样疾病(ILI)患者比例的激增转化为原始数据的估计值:超额患者100,000万,远远超过当时记录的不到XNUMX万例病例。我们的论文 被选中 - 经济学家,我们立刻遭到了同行科学家(并非随意的喷子)的攻击,他们指责我们扰乱公共卫生信息,淡化新冠疫情(因为病例越多意味着每例死亡人数越少),并引发自满情绪。即使在我自己的工作场所,一些曾经劝阻我分享2020年XNUMX月研究结果的科学家也更进一步,开始在推特上甚至在我们的Slack频道上大肆攻击,找各种机会批评我,阻挠我融入科学界的努力。

2020年秋季预测

根据我的理论,该理论预测了大流行和 2020 年 2 月的激增,纽约市各医疗机构的 ICU 入院人数在 2020 天内翻了一番,纽约市 XNUMX 年 XNUMX 月至 XNUMX 月的激增很可能是因为易感人群的减少而结束的,在新冠疫情之前,我们称这种人群状态为“群体免疫”。

如果这是真的,那么我们就能将未来的疫情与纽约市的疫情进行比较,并发现未来的疫情病例峰值与纽约市的人口死亡率相似。我和 Jutsin Silverman 开发了一个仪表盘,用于监控疫情,并与纽约市的曲线进行比较。2020 年夏天,我们看到许多未得到缓解的疫情证实了“纽约市曲线”。下面的数字需要一些时间来理解,但它们本质上是时间序列。 负担的时间表,使我们能够在类似的负担下比较不同日期发生的疫情的增长率。

2020 年 1 月,我与疾病预防控制中心预测团队分享了这些发现,为未来的疫情爆发提供了背景——如果美国疫情的病例数达到每 1,000 人死亡 2020 人的峰值,那么我自 XNUMX 年 XNUMX 月以来提出的理论将对此做出解释:群体免疫。

2020 年秋季美国各地的疫情普遍证实了“纽约市线”是疫情强度(速度和负担)的上限分位数,尤其是那些在几乎没有减缓 Covid-19 传播的州或县发生的疫情。

在疫苗问世之前,美国11个县的病例峰值滞后人口死亡率D(t+3,000)均收敛至纽约市的峰值线。这一峰值异常低于正统模型中严重程度高出4倍的虚线情景。

我制作了一些漂亮的图表,完美地阐释了这一发现。然而,在2020年秋季, 大巴灵顿宣言 (GBD)指出,我们的模型可能高估了疫情的严重程度(我的研究结果也表明了这一点),遏制政策可能会造成危害。虽然GBD被称为“群体免疫”策略,但作者并未提及群体免疫,尽管我个人认为2020年秋季疫情的峰值是由于群体免疫而达到的,这与它们与纽约市界线的收敛有关。下图是推断的相图,显示所有3,000多个美国县的疫情早在疫苗问世之前就已在纽约市界线以下汇聚至峰值,且疫情负担远低于虚线所示的传统估计值。

2020年1月,我的博士后导师要求我不要分享我的研究成果。她担心我关于群体免疫的说法可能会破坏她与州政府的关系,因为州政府给了她XNUMX万美元,让她对校园人群进行检测和追踪实验,而根据我的理论,这些实验是不必要的。根据我的理论,州政府应该将资源分配给缺乏非集体住房和医疗服务的部落和农村社区,而不是玩弄隔离大学生的实验。

由于这些分歧,我离开了蒙大拿州立大学,最终吸取了我从 Covid 短片中学到的教训:如果在我的专业领域内看到和说的某件事违背了惯例,那么我宁愿分享我的发现并受到批评,也不愿不分享我的发现并看着世界在毫无准备的无知中受苦。

约翰·伊奥尼迪斯的辩护

约翰·伊奥尼迪斯博士是斯坦福大学的著名教授。他在新冠疫情初期撰写文章,指出我们是在面对不确定性的情况下做出决策的,我们的政策可能会造成损害,而且疫情可能没有传统团队预测的那么糟糕。

伊奥尼迪斯博士在推特上遭到了众多学者的谩骂。这些学者认为伊奥尼迪斯是个贬低者,他们会抓住一切机会批评他。

伊奥尼迪斯博士曾发表一篇论文,指出那些在推特上拥有大量粉丝的学者,实际上发表的论文或引用数量并没有那么多;换句话说,那些在推特上自诩为“专家”的人,实际上可能并非最合适的专业咨询对象。伊奥尼迪斯博士用推特账号发表了这篇论文,许多学者随即发起了一场运动,声称用推特账号发表论文是不道德的,违反了机构审查委员会(IRB)的规定,并且是一种骚扰行为,可能会导致科学家成为攻击目标。

我持不同意见。我认为这条规则是人为编造的——推特账号是公开数据,机构审查委员会(IRB)没必要分析并公开发布数据。此外,许多批评约翰·伊奥尼迪斯骚扰科学家的人,也广泛分享并支持麻省理工学院一个发布他们称之为“反口罩”的账号的团体。我认为,如果这里存在任何伦理问题,那就是选择性地捏造研究伦理义愤来攻击伊奥尼迪斯,以及科学家们在图表中将“反口罩”的人群贴上“反口罩”等贬义标签的做法,其伦理道德令人质疑。

免疫力减弱

假设 2020 年秋季疫情在群体免疫阈值达到峰值,那么我们唯一能解释后续疫情的方法是免疫力减弱和免疫逃避的混合。

我曾与伦敦卫生与热带医学院的一个团队合作,短暂地接触了正统的思路,他们理解了第一个值得关注的变体——Alpha。当时我在对冲基金公司工作,负责分析SPAC(特殊目的收购公司,本质上是用于IPO的私募股权投资工具),并提供了 对 B.1.1.7 传播性的“IPO”或“初始系统发育观察”分析.

然而,根据我的理论,我们预计Alpha病毒会在疫情早期爆发的地区引发更大规模的疫情波动,这些地区可能是2020年秋季疫情激增较少的地方。这正是我们所看到的,这提供了免疫力减弱的证据。

不幸的是,在发现这一现象时,免疫力减弱被认为是错误信息,因为免疫力减弱意味着疫苗诱导的免疫力可能会减弱。如果自然免疫力和疫苗诱导的免疫力都减弱了,那么我们预计美国将在6年秋季疫情爆发六个月后出现病例激增,而这些后续疫情的传播率将与这些疫情的累积负担呈最负相关,与疫苗接种率无负相关性。事实上,到2020年2021月,我们看到了这种情况。

如果免疫力减弱,强制接种疫苗政策的成本效益比就会发生变化。如果2020年秋季的疫情并非自然群体免疫阈值,且免疫力不会减弱,那么强制接种疫苗或许是合理的。不幸的是,从我的理论角度来看,2020年秋季的疫情很可能在自然群体免疫阈值达到峰值,然后免疫力就会减弱,这让人质疑强制接种疫苗是否明智,因为疫苗本身存在一定风险,而且无法预防未来的感染。

最终,在2021年100月,美国疾病控制与预防中心公布了普罗温斯敦疫情的调查结果,证明了XNUMX%免疫逃避的确凿证据,接种疫苗的患者与未接种疫苗的患者发病率相同。

2020年秋季自然群体免疫阈值和三角洲地区免疫逃避的相同理论,导致了这样一种理论:未来的疫情将具有特征性的时间尺度,因为它们会在相对未缓解的疫情中耗尽易感人群,并吞噬免疫力减弱的人群。上图显示,南非各省的Omicron疫情定义了美国各州Omicron疫情的特征时间尺度,这再次证实了我所遵循的这一理论路径。

Covid起源

回想一下,在新冠疫情爆发之前,我研究的是病原体从蝙蝠向人类的溢出,以及将病原体归因于宿主或来源的统计方法。疫情预测结束后,我又回到了病原体溢出的问题,即如何将这种生物因子归因于其来源。

我阅读了相关文献,发现它们存在缺陷,基于有缺陷的数据、有缺陷的分析或不合理的假设得出了异常有力的结论。我写了一篇文章,批评了Pekar等人的一篇论文,该论文声称SARS-CoV-2进化树底部的两个大分支是两次溢出事件的证据。我们指出,作者的方法并不能证明他们的结论,而且他们排除了一些序列,这些序列使其SARS-CoV-2进化树底部有两个大分支的前提失效。这激怒了人畜共患疾病起源论的支持者,也让我成了众矢之的—— 仔细阅读我们预印本的评论以了解详情。

我与瓦伦丁·布鲁特尔(Valentin Bruttel)和托尼·范东根(Tony VanDongen)合作撰写的下一篇论文则更加异端。实验室起源理论围绕着一个弗林蛋白酶切位点展开,据推测该位点被插入了病毒,但要在冠状病毒中插入弗林蛋白酶切位点,需要复制病毒的DNA。 我们在 SARS-CoV-2 基因组中发现的证据与制作冠状病毒 DNA 拷贝的主要方法一致。

这也得到了 “经济学家” 以及 电报 等等。然而,在每一个案例中,这些期刊都加剧了正统派的争议,这些正统派都与武汉病毒研究所(据信进行了这项工作)或美国国家过敏和传染病研究所(NIAID)有着密切的联系。NIAID是一家总部位于美国的健康科学资助机构,被发现在2019年资助了那些提议在2018年武汉SARS冠状病毒DNA拷贝中插入弗林蛋白酶切割位点的研究人员。

我的惩罚

最近的证据证实了我们的理论就像样本外的证据证实了我的新冠疫情爆发和群体免疫阈值理论一样,仅仅证实似乎不足以让我重返学术界。分歧带来的恶意语气,以及那些被数据本身证明是错误的知名教授们受伤的自尊,造就了一个充满恶意、愤慨的正统观念的社群。像我这样的罪人是没有希望重新被接纳的,因为在经历了足够多的斗争和自尊心受伤之后,每个委员会、每个编辑委员会、每个会议委员会里都会有人因我的异端邪说而得罪。

现在,在与正统学者的交往中,我被贴上了异端邪说的“红色字母”标签,他们不顾一切地要从铺天盖地的数据和证据中捍卫自己的地盘。 A安非他明, Brownstone Boy,Covid 最小化者, D否定主义者等等。在许多人眼中,我被视为贱民,就因为我拥有发现事物的洞察力,以及坚持自己发现的勇气。没有什么比后辈拒绝屈服更能激怒一位愤慨的前辈的自尊心了,就好像拳击手在那些打我的人拳头上骨折了,却要怪罪我一样。

我想与那些展望未来职业生涯、却不知该走哪条路的未来科学家分享这段旅程。我在这里遇到的岔路口,其他人也会遇到。你可能会发现一些东西,一些只有你这样的专业人士才能发现的东西,也可能会遭遇各种各样的遭遇,从劝阻、不分享你的工作成果,到彻头彻尾的敌意,甚至如果你分享了你的工作成果,你还会被那些你曾经认为是同事或朋友的人疏远。

你会看到指引你走向正统的迹象。你会俯视那片充满争议的、令人痛苦的、溃烂的、荆棘丛,踏上通往异端的道路,你可能会情不自禁地想要放弃那个“猩红H”。如果你想要维持你一直以来所想象的事业,如果你追求舒适与共事,那么无论如何,都不要冒险,不要做任何有争议的事情,也不要批评那些身居要职的人。你的肖像或许会被悬挂在某座建筑的大厅里,而你除了热爱这座曾经容纳过你的建筑,或者至少是那个选择不做任何有争议的事情的你之外,永远不会再有其他的感觉。

我告别了正统的下坡路,攀登了异端的险峻山峰,这的确带来了巨大的改变。在我的内心深处,我依然是母亲的孩子,对二氧化碳充满好奇,对光合作用着迷,对原子充满敬畏。

追随异端之路,我遍体鳞伤,拳打脚踢,被殴打、训斥,被人挂在数字示众柱上,还遭受过各种侮辱。我愿意再次经历这一切,因为只有在这条路上,你才能发现自己是谁。随着时间的推移,你会找到其他同样勇敢地坚守原则的人,一个异端朋友比100个正统同事更有力量。在异端这风雨飘摇的山顶上,你会找到一个由最聪明的头脑组成的社群,找到真正的朋友,他们把归属感置于信仰之上。你会学会在被打的时候笑,在被攻击的时候变得更坚强,在被憎恨的时候去爱。

我不会建议同事去攀登异端邪说的艰辛之路,而只会建议那些最强大、最聪明、最真诚、最勇敢的朋友去攀登。如果你能挺过这段攀登,那么在另一边,你就会发现自己的优势,并最终蓬勃发展。

你们或许会被那些卑鄙之人鄙视,他们觉得你们在被他们操控时很有用,而你们却将灵魂改造成他们所掌控的对象。但你们也会被那些前辈令人敬佩的异端科学家所钦佩。你们将在一个由真诚、不受束缚的灵魂组成的多元化社群中受到爱戴和尊重。即使我们意见不合,我们也会礼貌地表达,并确保你们仍然属于我们社群。因为很少有人比我们这些被流放到这座山巅异端之城的人更了解不宽容的腐蚀性。

转载自作者 亚组


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如需转载,请将规范链接设置回原始链接 褐石研究所 文章和作者。

作者

  • Alex Washburne 是一位数学生物学家,也是 Selva Analytics 的创始人兼首席科学家。 他研究生态、流行病学和经济系统研究中的竞争,研究 covid 流行病学、流行病政策的经济影响以及股市对流行病学新闻的反应。

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